Service d'Aide et d'Assistance Micro-informatique à l'Utilisateur (SAAMU)

Pour ce faire, vous n'aurez qu'à suivre ce tutorial.
Après l'avoir testé, je confirme que ça marche !

1. Branchez votre clé USB ou votre disque portable sur votre PC.
2. Créez un répertoire sur votre clé qui se nomme Skype ou Skype Portable
3. Ouvrez le répertoire où est installé Skype sur votre PC
4. Copiez le fichier skype.exe et collez ce fichier dans le répertoire que vous avez créé sur votre clé USB.
5. Dans le répertoire qui accueille Skype sur votre clé, créez un sous-répertoire qui se nomme « data »
6. Ouvrez Microsoft Notepad (Bloc-notes) et créez un document dans lequel vous insérez cette ligne de commande : skype.exe /datapath:”Data” /removable
7. Sauvegardez ce document en le nommant : skype.bat
8. Glissez et déposez ce document dans le répertoire Skype sur votre clé USB

J'ajouterais seulement que vous risquez de devoir débloquer votre pare-feu pour permettre à Skype d'établir la connexion.
Pour cela, rendez-vous dans les exceptions du pare feu, Ajouter un programme, et allez à la recherche du programme sur la clé USB

Voilà c’est fait, lorsque vous démarrerez Skype sur votre clé USB, il ne vous restera plus qu’à donner les informations de votre compte et vous serez prêt à faire des appels.

Source : http://www.slideshare.net/bdescary/comment-crer-une-version-portable-de-skype